小柴胡汤，仍旧出自《汤液经法》，张仲景在《伤寒论》中引用而流传，在陶弘景《辅行诀》中叫大阴旦汤，是治天行疫病的，原文如下：
大阴旦汤：治凡病头目眩晕，咽中干，每喜干呕，食不下，心中烦满，胸胁支满，往来寒热者方。
柴胡八两人参*芩生姜各三两甘草炙，二两芍药四两大枣十二枚半夏一升，洗（《传承集》注：一升洗：此下抄本中有新补小字按语：“按：《伤寒论》小柴胡汤加芍药。”此按非范抄本所固有，乃抄阅者据《敦煌古医籍考释》页化裁人此。）
右八味，以水一斗二升，煮取六升，去滓。重上火，缓缓煎之，取得三升，温服一升，日三服。
伤寒论条文
（37）太阳病，十日以去，脉浮细而嗜卧者，外已解也。设胸满胁痛者，与小柴胡汤；脉但浮者，与麻*汤。小柴胡汤方：
柴胡半斤*芩三两人参三两甘草炙生姜各三两，切大枣十二枚，擘半夏半升，洗右七味，以水一斗二升，煮取六升，去滓，再煎取三升，温服一升，日三服。
（９６）伤寒五六日中风，往来寒热、胸胁苦满、嘿嘿不欲饮食、心烦喜呕，或胸中烦而不呕，或渴，或腹中痛，或胁下痞鞕，或心下悸、小便不利，或不渴、身有微热，或咳者，小柴胡汤主之。小柴胡汤方：
柴胡半斤*芩三两人参三两半夏半升，洗甘草炙生姜各三两，切大枣十二枚，擘右七味，以水一斗二升，煮取六升，去滓，再煎取三升，温服一升。日三服。若胸中烦而不呕者，去半夏人参，加栝楼实一枚；若渴，去半夏，加人参，合前成四两半，栝楼根四两；若腹中痛者，去*芩，加芍药三两；若胁下痞鞭，去大枣，加牡蛎四两；若心下悸，小便不利者，去*芩，加茯苓四两；若不渴，外有微热者，去人参，加桂枝三两，温覆微汗愈；若咳者，去人参、大枣、生姜，加五味子半升、干姜二两。 （９７）血弱气尽，腠理开，邪气因入，与正气相搏，结于胁下。正邪分争，往来寒热，休作有时，嘿嘿不欲饮食，藏府相连，其痛必下，邪高痛下，故使呕也，小柴胡汤主之。服柴胡汤已，渴者，属阳明；以法治之。 （９８）得病六七日，脉迟浮弱、恶风寒、手足温，医二三下之，不能食而胁下满痛，面目及身*，颈项强，小便难者，与柴胡汤，后必下重。本渴饮水而呕者，柴胡汤不中与也，食谷者哕。 （９９）伤寒四五日，身热、恶风、颈项强、胁下满、手足温而渴者，小柴胡汤主之。 （１００）伤寒，阳脉涩，阴脉弦，法当腹中急痛，先与小建中汤；不差者，小柴胡汤主之。
当然《伤寒论》也是治疗天行疫病的，用伤寒的方子不加减治疗内科杂症，虽有疗效，但是不能持久，就是因为它们是主要治疗天行疫病的，是祛邪为主扶正为辅的，所以有伤寒专家奇怪：怎么伤寒的方子治病一开始效果好，用着用着就达到一个平台期，疗效就是上不去呢？就是这个原因。
言归正传，扶肝派认为小柴胡汤，即是治疗外邪侵入中医肝胆系统的一个主方，外邪侵入太阳膀胱经，会项背强几几（shu），张仲景把它归为太阳证，主方是麻*汤、桂枝汤，但是外邪侵入中医肝胆系统，则是有神经功能失调的症状。因为正如扶肝派所认为的：中医的肝即是内藏神经系统，外以脊柱躯干为支架，肝经胆经为沟通内外上下的气血通道，膀胱经、督脉为外卫的大系统（详情请阅扶肝派导论一章），督脉为阳气之海，阳气弱，病邪通过太阳膀胱经，进到少阳胆经，威胁肝系统，肝脏作为将*之官，必须要做出反应，当然在病邪到了太阳经时，肝脏已经做出了反应，发热即是反应，不能自愈，则桂枝汤扶阳助之，麻*汤散邪助之，再不愈，（原因很多：比如邪太盛，或者过汗伤卫阳，误下伤脾阳），肝胆腹背受敌，病邪兵临城下，开始侵犯神经系统，就出现一系列的神经系统失调的症状，“头目眩晕，咽中干，每喜干呕，食不下，心中烦满，胸胁支满，往来寒热”见《辅行诀》，“血弱气尽，腠理开，邪气因入，与正气相搏，结于胁下”、“（９６）伤寒五六日中风，往来寒热、胸胁苦满、嘿嘿不欲饮食、心烦喜呕，或胸中烦而不呕，或渴，或腹中痛，或胁下痞鞕，或心下悸、小便不利，或不渴、身有微热，或咳者”《伤寒论条文》分析古书条文可见：此时周围神经系统受到侵犯，肋间神经循行两协，所以可见胸胁苦满；植物神经受邪可见嘿嘿不欲饮食，心烦喜呕，食不下，心下悸；脑神经受扰，可见头目眩晕；支配腺体分泌的神经功能失调，则腺体分泌紊乱，可见咽干；得病六七日，脉迟浮弱、恶风寒、手足温，医二三下之，不能食而胁下满痛，面目及身*，颈项强，小便难者，与柴胡汤，后必下重，这段条文说的是病邪已经攻陷太阳经、肝脏外围、少阳胆，已经到了脾胃了，再只用小柴胡汤应该不对症了，由此可见小柴胡汤是针对太阳失守，脾胃受损，肝胆受邪而设的。
从方子我们可以看出，柴胡性发散，入肝胆经，重用为君，为主帅，直指强敌，*芩为臣，接受柴胡的指挥，清除肝胆经的病邪，半夏、生姜、人参健脾燥湿温中止呕为佐，甘草大枣甘缓调和柴胡苦辛燥之性，防止发散太过，伤及肝阴，大阴旦汤加白芍也是此意。
柴胡对于少阳胆经病相当于麻*对于太阳膀胱经病，麻*散太阳经的外邪，柴胡散少阳胆经的外邪，胆为肝之外腑，肝为胆之本脏，胆通于肝，柴胡发散太过易伤肝阴，所以有“柴胡劫肝阴”之说，临床上经常见到柴胡用量过大，患者出现头目昏蒙的现象，同样麻*发汗太过也会伤及肾阴，患者出现燥热心烦、口渴喜饮的症状。柴胡性发散，一个主要的药理作用是发汗，大汗易伤阳，易造成汗脱，正虚，所以不可久用，应该中病即止。
和大多数伤寒、经方学派不同，本人在治疗感冒上用小柴胡汤不多，绝大多数感冒发烧，我用小青龙汤加味即可把它遏止于太阳经证，很快就退烧了。本人反对一感冒发烧就用柴胡剂，证不对，暂时退烧，反倒降低了免疫力，还要烧几天才退，过段时间又感冒了，陷于西药退烧一样的误区。感冒发烧只有出现头目眩晕、不欲饮食，胸胁苦满，往来寒热，才建议用。
需要警醒的是：目前，小柴胡汤在全世界都滥用了！因为它的退热作用，首先在日本，其次在中国，小柴胡汤成了治疗感冒的圣药，感冒发烧必用小柴胡，所以出现了众多肝肾损害的病例，药不对症副作用是必然的！还有众多的经方学派，他们把小柴胡汤的地位提到了一个前所未有的高度，提伤寒必有小柴胡汤，好像不用小柴胡汤就不是经方派一样，实在是对后学者的一种误导。
拨乱反正:单纯的发烧不能遽用小柴胡汤，真正的到了邪扰肝胆的时候再用小柴胡，而且不能久用，人的正气是有限的，过度发散肝阴肝阳，必然要伤到脾胃，以及肾脏，后果严重。我要说的就是这些.
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